Cette th se propose une m thode d'exploration de donn es biologiques dans un cadre de R alit Virtuelle. Ces donn es se pr sentent sous deux formes: la forme factuelle, provenant des immenses banques de donn es biologiques, et la forme textuelle, savoir l'ensemble des donn es non structur es pr sentes dans les millions de publications. L'enjeu est de proposer une approche d'exploration et d'interaction, qui permettent couvrir la nature vari e de ces donn es biologiques, qui soit adapt e aux donn es massives, et enfin qui r ponde aux besoins des biologistes. Ainsi sur la base de l' tude des besoins des utilisateurs et de leurs usages, une repr sentation visuelle adapt e a t choisie, dans laquelle la s mantique des donn es tudi es est traduite par des propri t s visuelles, g om triques, ou topologiques, choisies initialement par l'utilisateur. Plusieurs applications de cette approche, r alis es en collaboration avec des biologistes ou des bioinformaticiens sont pr sent es, afin de mesurer la pertinence de cette solution d'exploration, face plusieurs probl matiques d'analyse de donn es biologiques.